Po dopełnieniu wszystkich formalności można spokojnie przejść do realizacji projektu. Wnioskodawcy są zobowiązani, aby czynić to zgodnie z przedstawionym wnioskiem i kosztorysem ostatecznym.
Projekt należy wiernie udokumentować, a więc zadbać o zebranie wszystkich wymaganych Regulaminem załączników. Więcej na ten temat w zakładce Jak uzyskać dofinansowanie? > V ETAP.
Podczas realizacji projektu każdy wydatek ze środków UJ musi zostać udokumentowany fakturą VAT wystawioną na UJ (dane do faktury dostępne są na stronie internetowej Kwestury). Możliwe jest pokrycie kosztu z własnych środków i uzyskanie zwrotu, a także skorzystanie z faktury przelewowej (z odroczonym terminem płatności), dzięki której UJ zapłaci wykonawcy bezpośrednio. Więcej na ten temat w zakładce Jak uzyskać dofinansowanie? > V ETAP. Ważne jest także, żeby nie dokonywać płatności gotówkowych, gdyż co do zasady nie da się ich rozliczyć.
Istnieje możliwość zmiany terminu realizacji projektu. Jeżeli jest to konieczne, należy w takiej sytuacji przesłać mailowy wniosek do Przewodniczącego RKN UJ (e-mail: przewodniczacy.rkn@uj.edu.pl) razem z: 1) wskazaniem nowych dat; 2) uzasadnieniem zmiany. Istotne jest to, że wniosek o zmianę terminu rozpoczęcia można złożyć tylko jeśli projekt jeszcze się nie rozpoczął, a wniosek o zmianę terminu zakończenia – tylko jeśli się nie zakończył.